Amrum weist eine herausragende Bedeutung für die vorkommende Tier- und Pflanzenwelt der Nordseeküste auf. Die Besonderheit und die Bewahrung dieser einmaligen Flora und Fauna wird durch die Schutzgebiete, die mit Ausnahme der Siedlungsflächen die Insel umfassen, deutlich. So sind die Amrumer Odde wie auch die Amrumer Dünen Naturschutzgebiet. Der Strand und die ausgeprägte Dünenlandschaft sind Vogelschutzgebiet. Die Salzwiesen, die sich durch eine hohe Salztoleranz auszeichnen, sind in der gesamten EU streng geschützt. Die Geest mit Heideflächen und Grünländer sind Landschaftsschutzgebiet.